Нет, не согласен.
Все и всегда идет не так, как кому-то хочется, а по-жизни.
В данном случае - по третьему варианту.
Все эти и очень многие другие, побочные изменения возникали постепенно.
Но далеко не все реализовывались сразу.

В "Пророчестве" приводится пример с жирафой:

Большинство мутаций ухудшают первоначальный «проект», зачастую, до такой степе-ни, что организм становится нежизнеспособным еще «в утробе» матери.
Некоторые – не такие смертельные, и организм жизнеспособен, но – мешают жить и выживать в окружающей среде.
Например, слишком короткие или слишком длинные ноги у какой-нибудь антилопы не позволят убежать от хищника. С короткими – все ясно, а со слишком длинными - антилопа будет очень неустойчива на бегу и лишена маневренности.

Но иногда какая-то мутация оказывается полезной и помогает жить и выживать.
Те же длинные ноги помогают жирафе дотянуться до веток, до которых не могут дос-тать никакие другие животные.
И они оказываются монополистами в своем ярусе ветвей.
Правда, одновременно с длинными ногами пришлось обзавестись и длинной шеей, но это сделало благоприобретенную мутацию еще более полезной.

Еще один момент, который просто необходимо иметь в виду: мутация не должна быть резкой.
Те же ноги и шея у жирафы не вытянулись одномоментно, а удлинялись постепенно, поколение за поколением, производившие свои мутации, менявшие и приспосабливавшие остальные части организма в этой, доминировавшей мутации.
Иначе первая же особь с резкой мутацией не дожила бы до детородного возраста и не успела бы передать свое замечательное приобретение потомству.
Даже, если бы ее не съели хищники.
Почему?

Да хотя бы по одной только причине резкого колебания давления крови в головном мозгу!
При росте в 4 метра давление крови при поднятой голове на 200 грамм ниже, чем на уровне крупа, а при опущенной – на те же 200 грамм выше!
При попытке полакомиться листьями у жирафы закружилась бы голова от недостатка крови, а при попытке попить воды – глаза бы просто вылезли из орбит!
Не считая других, несовместимых с жизнью, неудобств.

И мы не имели бы в природе животное, благодаря которому родилось выражение, ставшее хрестоматийным:
- Этого не может быть, потому что этого не может быть никогда!

Но именно благодаря отсеву неполезных мутаций и постепенному накоплению в гено-ме полезных, процесс развития имеет возможность идти, с человеческой точки зрения, в ра-зумном направлении.
Без чьего-то вмешательства со стороны.
Параллельно с удлинением ног и шеи, у жирафы развился специальный механизм, ста-билизирующий давление крови в голове.
Поэтому жирафа никогда не падает в обморок, поднимая или опуская голову.

То есть, природа, грубо говоря, не только не меняет резко какую-то деталь в организ-ме, по, параллельно с изменением этой детали, так же постепенно корректирует и сопря-женные с этой деталью другие части организма.
И даже систему управления этого организма.
То есть, его взаимодействие с окружающей средой.
.........
Организм строится по программе, записанной в памяти генома.
И если в геном вкралось изменение, которое мы называем мутацией, он строится в со-ответствии с налично имеющейся, измененной информацией.

В США, в каком-то водоеме, стали очень часто попадаться лягушки-уроды.
У какой-то было больше конечностей, чем положено, у какой-то – меньше.
У какой-то – не было совсем, а у какой-то из одной ноги росла еще одна.
Полный кошмар!

Причина – отравление водоема какой-то промышленной гадостью, сливаемой в этот водоем.
Лягушки очень восприимчивы к нарушению экологии, это немедленно сказывается на их геноме.
В результате - или появляются всякого рода уроды или они просто вымирают, потому что потомство оказывается нежизнеспособным.

Вероятно, информация по мутациям остается записанной в памяти генома выжившего организма.
Возможно, навсегда.
По крайней мере – очень надолго.
Возможно, поэтому в геноме находят так много «лишней» информации, вроде бы, не относящейся ни к каким генам.

Вероятно, именно поэтому и возможно комплексное изменение организма с уклоном в сторону какой-то одной, особенно полезной мутации.
Ведь крайне маловероятно, чтобы в одном и том же организме одновременно возникло сразу несколько разных мутаций, взаимно поддерживающих и дополняющих друг друга!
Как в нашем примере с жирафой.

Гораздо более вероятно, что информация по нужным мутациям в геноме уже есть, но, до поры, до времени, она блокирована.
Или просто висит, как не читаемый, не реализуемый балласт из-за неполноты текста.
И разблокируется, или прочитывается, при удачном стечении обстоятельств.
Это удачное стечение обстоятельств и приводит к закреплению полезной мутации, а комплексное изменение, в конечном итоге, может привести к образованию даже нового ви-да.

Естественно, неудачных стечений обстоятельств неизмеримо больше, и подавляющее большинство мутировавших геномов погибает или не дает потомства.

Поэтому, все «совершенство и гармония» окружающей нас природы – не милость гос-подня.
Оно оплачено мириадами существ, а еще больше – геномов, так или иначе расстав-шихся со своими жизнями, чтобы эту гармонию и совершенство обеспечить.

Часть 4, глава 31.